然而，善耆这些具有改革意义的作法在当时并不被认同。终于，在他提出撤销步军统领衙门的建议时，遭到了顽固守旧派的抵制和反对，唆使步军统领衙门的2万余官兵到******那儿控诉，善耆又一次被罢免。

说起来，善耆找刺客帮忙已经不是一次两次了，早在宣统二年，汪精卫秘密潜来北京，图谋刺杀溥仪的父亲、清王朝摄政王载沣。汪精卫行刺不成被捕，朝廷责成善耆负责审理此案。审案过程中，善耆看到汪精卫的手稿《革命之趋势》、《革命之决心》、《告别同志书》之后，感慨万分，遂有了不杀之意。此外，善耆已经预感到清王朝的统治岌岌可危，认为此时杀几个革命党人无济于事，不如以怀柔手段对付之。在其力促之下，汪精卫得到从轻发落，仅以“误解朝廷政策”之罪名，被判处永远监禁。不久，又得以释放。

汪精卫入狱期间，善耆多次到狱中看望他，想借机想说服汪精卫留下，从而使他能为己所用。但结果是，汪精卫远没有善耆想的那么简单，两人的谈话每次都如一场辩论赛，二人旗鼓相当，谁也说服不了谁。善耆私下里与人半是玩笑半认真地说：“如果不是出生在王族，我早就加入革命党反叛朝廷了。 ”而汪精卫见善耆谈吐文雅，远见卓识，非一般愚钝无能的昏官污吏所能比，也生敬佩之心。

宣统三年十月，张绍曾和蓝天蔚在滦州发动“兵谏”，清廷被迫下罪己诏，宣布解除党禁、****国事犯。乘此机会，善耆建议清廷释放汪精卫。

宣统三年，武昌起义爆发，清王朝的统治陷入土崩瓦解的状况。民国元年，善耆与良弼、溥伟、铁良等组织“君主立宪维持会”（俗称“宗社党”），反对南北议和与清帝逊位；之后，宗社党发布宣言，主张罢黜袁世凯，组建“战时皇族内阁”，由铁良任总司令，组织忠于清室的军队与革命军决战。1月17日，清廷召开御前会议，讨论溥仪退位事，宗室溥伟竭力反对。良弼被革命党人彭家珍炸伤，两日后死亡，宗社党胆落，王公亲贵纷纷逃匿。

同年2月，溥仪退位，清朝灭亡。在川岛浪速的怂恿下，善耆携家人逃到旅顺，继续为复辟清朝而努力。来到旅顺后，善耆死心塌地投入日本人怀抱，鼓吹“中日提携”。日本明治天皇去世举行大丧时，善耆竟然不知廉耻，竟以清室贵胄之尊，身着丧服，斋戒素食，为其服丧三天。

民国三年元旦，日本大正天皇即位，他冒着刺骨的寒风登上旅顺白玉山，拜谒日本侵华将士的亡灵。为拉近与川岛浪速的关系，他还将最小的女儿、年仅六岁的十四女金壁辉（也就是川岛芳子）送给川岛当养女。每逢川岛来拜访，他必带领全家老小到家门口排队等候，亲自上去拥抱迎接，还让最年轻的侧妃陪着川岛浪速畅饮。

民国四年，袁世凯称帝，善耆认为复辟的时机成熟了，便开始紧锣密鼓地活动。他的计划是：由辽宁千山的部队点起讨袁烽火，与巴布扎布的蒙古军队合力拿下北京，建立一个“包括内外蒙古、满洲三省和华北为一体”的大王国，然后请溥仪即位。为了计划成功，善耆动用了全部家财，把自己所有的农田、森林、金矿、牧场、煤矿都抵押了出去，向日本财阀大仓喜八郎借款一百万元，他用这笔经费，招募了大量土匪，进行军事训练，磨刀霍霍，踌躇满志。正当善耆以为复辟指日可待时，袁世凯暴毙，“扶清讨袁”的口号已经失去意义。日本人为了避免引起中国人的反感，开始压制善耆，不让其轻举妄动，满蒙运动再告失败。但是，这并不影响善耆跟他们的合作，如今善耆决定杀掉张作霖，自然得找他们帮忙。

却说张作霖按时在奉天火车站迎接了中村都督，在这种事情上，张作霖轻车熟路，根本不用费多大麻烦，也不用太费心思就吧中村哄得一愣一愣的，当隆重的仪式结束后，张作霖陪同中村都督下榻大和宾馆。张作霖的车队在返回奉天督军府的路上，在小西关南满银行门前附近遭到了“决死团”成员三村丰等人的伏击。两枚炸弹在车队中爆炸，张作霖险些遇难。

久经沙场的张作霖一看大事不妙，立即跳下马车，拉过卫兵的马就蹿上马背，以极快的速度同卫兵互换上衣，然后在四周马队的保护下，穿过大西边门绕道奔回将军署。当张作霖骑马飞驰经过奉天图书馆时，突然从图书馆门洞里跑出来一个人，手拿炸弹向张作霖扔去。由于张作霖骑马的速度很快，炸弹爆炸后，气浪只炸飞了张作霖的帽子，人倒是安然无恙。相反，善耆派来的刺客却被炸弹的弹片击中要害死了。